| エヴァンゲリオン始動 | |
| 味方初期ユニット （パイロット） |
エヴァ初号機（シンジ） |
| 味方増援ユニット （パイロット） |
エヴァ初号機撤退：味方ユニット×14、トロイホース（ブライト） |
| 敵初期配置ユニット （パイロット） |
黄軍：第3使徒サキエル（サキエル） |
| 敵増援配置ユニット （パイロット） |
エヴァ初号機撤退：赤軍：アシュラテンプル（ギャブレー）、バッシュ（ハッシャ）、 アローン×8、グライア×9 |
| 入手パーツ等 | アシュラテンプル（ギャブレー）：ブースター |
| シナリオ終了後 参入・離脱ユニット |
参入：エヴァ初号機（シンジ） |
| 備考 | ・エヴァンゲリオン出撃デモ有り ・エヴァ初号機（シンジ）は撃墜されると、暴走する ・第3使徒サキエル（サキエル）は残りHP70%以下で撤退 ・第3使徒サキエル（サキエル）撤退後、エヴァ初号機も撤退 ・アシュラテンプル（ギャブレー）が撃墜又は残り敵5機以下で赤軍全機撤退 |
※ターン数表示記号の意味：PP（プレイヤー側フェイズ）、EP（敵側フェイズ）